suʻesuʻegabg

Fa'ailoaina o le genome ma le au'ili'iliga o le fa'aalia o mea e fa'atonutonu ai le tuputupu a'e o le sinapi i lalo o tulaga o le lāmala

E lē tutusa le tufatufaina o timuga fa'avaitaimi i le Itumalo o Guizhou, ma e tele atu timuga i le tautotogo ma le taumafanafana, ae o la'au rapeseed e faigofie ona a'afia i le faigata o le lāmala i le tautoulu ma le taumalulu, lea e matuā a'afia ai le seleselega. O le sinapi o se fa'ato'aga fa'apitoa o le suāuu e totō tele i le Itumalo o Guizhou. E malosi lona tete'e i le lāmala ma e mafai ona totō i vaega maugā. O se puna'oa tele o kenera e tete'e i le lāmala. O le mauaina o kenera e tete'e i le lāmala e matuā tāua tele mo le fa'aleleia atili o ituaiga sinapi, ma le fa'afouga i puna'oa o siama. E taua tele le sao o le aiga GRF i le tuputupu a'e ma le atina'eina o la'au ma le tali atu i faigata o le lāmala. I le taimi nei, ua maua kenera GRF i le Arabidopsis 2, araisa (Oryza sativa) 12, rapeseed 13, vavae (Gossypium hirsutum) 14, saito (Triticum), aestivum)15, millet pearl (Setaria italica)16 ma le Brassica17, ae leai ni lipoti o kenera GRF ua maua i le sinapi. I lenei suʻesuʻega, na faʻailoaina ai genes o le aiga GRF o le sinapi i le tulaga lautele o le genome ma o latou uiga faaletino ma vailaʻau, sootaga faʻa-evolusi, homology, motifs faʻasaoina, fausaga o genes, duplications genes, cis-elements ma le tulaga o le seedling (tulaga e fa lau). O mamanu o le faʻaalia i lalo o le atuatuvale o le lāmala na iloiloina atoatoa e tuʻuina atu ai se faʻavae faasaienisi mo nisi suʻesuʻega i luga o le gaioiga gafatia o genes BjGRF i le tali atu i le lāmala ma ia maua ai genes sui mo le faʻatupuina o le sinapi e teteʻe i le lāmala.
E tolusefulufa kene BjGRF na fa'ailoaina i le genome o le Brassica juncea e fa'aaoga ai su'esu'ega HMMER e lua, o ia mea uma e aofia ai vaega o le QLQ ma le WRC. O fa'asologa o le CDS o kene BjGRF ua fa'ailoaina o lo'o tu'uina atu i le Supplementary Table S1. O igoa o le BjGRF01–BjGRF34 e fa'atatau i lo latou nofoaga i luga o le chromosome. O meatotino fa'aletino o lenei aiga e fa'ailoa mai ai o le umi o le amino acid e matua'i fesuisuia'i lava, e amata mai le 261 aa (BjGRF19) i le 905 aa (BjGRF28). O le isoelectric point o le BjGRF e amata mai le 6.19 (BjGRF02) i le 9.35 (BjGRF03) ma le averesi o le 8.33, ma le 88.24% o le BjGRF o se porotini fa'avae. O le mamafa molecular o le BjGRF e mai le 29.82 kDa (BjGRF19) i le 102.90 kDa (BjGRF28); O le fa'asinomaga o le lē mautu o polotini BjGRF e amata mai le 51.13 (BjGRF08) i le 78.24 (BjGRF19), e sili atu uma i le 40, e fa'ailoa mai ai o le fatty acid index e amata mai le 43.65 (BjGRF01) i le 78.78 (BjGRF22), o le averesi o le hydrophilicity (GRAVY) e amata mai le -1.07 (BjGRF31) i le -0.45 (BjGRF22), o polotini BjGRF hydrophilic uma e iai a latou tau GRAVY leaga, lea atonu e mafua mai i le leai o se hydrophobicity e mafua mai i toega. O le vavalo i le tulaga o le sela i lalo ifo o le sela na faaalia ai e mafai ona maua ni porotini e 31 ua faailogaina i le BjGRF i totonu o le nucleus, e mafai ona maua le BjGRF04 i totonu o peroxisomes, e mafai ona maua le BjGRF25 i totonu o le cytoplasm, ma e mafai ona maua le BjGRF28 i totonu o chloroplasts (Laulau 1), o loʻo faʻaalia ai e mafai ona maua le BjGRFs i totonu o le nucleus ma faia se matafaioi taua i le faʻatonutonuina o se transcription factor.
O le su'esu'ega phylogenetic o aiga GRF i ituaiga eseese e mafai ona fesoasoani e su'esu'e ai galuega faatino a kenera. O le mea lea, o fa'asologa atoa o amino acid o le 35 rapeseed, 16 turnip, 12 araisa, 10 millet ma le 9 Arabidopsis GRFs na sii mai ma fausia ai se la'au phylogenetic e fa'avae i luga o le 34 BjGRF genes ua fa'ailoaina (Ata 1). O vaega laiti e tolu e iai le aofa'i eseese o sui; E 116 GRF TFs ua vaevaeina i ni vaega laiti se tolu (vaega A~C), e aofia ai le 59 (50.86%), 34 (29.31%) ma le 23 (19.83)% o GRFs, i le fa'asologa. I totonu oi latou, e 34 sui o le aiga BjGRF o lo'o salalau solo i vaega laiti e 3: 13 sui i le vaega A (38.24%), 12 sui i le vaega B (35.29%) ma le 9 sui i le vaega C (26.47%). I le faagasologa o le polyploidization o le sinapi, e eseese le aofaʻi o genes o le BjGRFs i aiga eseese, ma atonu na tupu le faʻateleina ma le leiloa o genes. E taua le maitauina e leai se tufatufaga o le araisa ma le millet GRFs i le vaega C, ae e 2 le araisa GRFs ma le 1 le millet GRF i le vaega B, ma o le tele o le araisa ma le millet GRFs ua faʻaputuina i le tasi lala, e faʻaalia ai o le BjGRFs e fesoʻotaʻi vavalalata ma dicots. I totonu o na mea, o suʻesuʻega sili ona loloto i le galuega a le GRF i le Arabidopsis thaliana ua maua ai se faʻavae mo suʻesuʻega faʻatino o le BjGRFs.
La'au phylogenetic o le sinapi e aofia ai le Brassica napus, Brassica napus, araisa, millet ma sui o le aiga Arabidopsis thaliana GRF.
Su'esu'ega o kene fa'asolosolo i le aiga o le sinapi GRF. O le laina efuefu i le tua e fai ma sui o se poloka fa'atasi i le genome o le sinapi, o le laina mumu e fai ma sui o se paga o toe fa'asolosolo vaevaeina o le kene BjGRF;
O le fa'aalia o le kene BjGRF i lalo o le fa'alavelave o le lāmala i le la'asaga lona fa o lau. O fa'amaumauga qRT-PCR o lo'o fa'aalia i le Laulau Fa'aopoopo S5. O eseesega taua i fa'amaumauga o lo'o fa'ailoa mai i mata'itusi laiti.
A o faaauau pea ona suia le tau o le lalolagi, o le suʻesuʻeina o le auala e feagai ai faatoaga ma le faigata o le lamala ma le faaleleia atili o latou auala e onosaia ai ua avea ma autu vevela o suʻesuʻega18. A maeʻa le lamala, o le a suia le fausaga o le tino, le faʻaalia o kene ma faiga o le metabolism o laau, lea e ono taitai atu ai i le taofia o le photosynthesis ma le faalavelaveina o le metabolism, e aafia ai le fua ma le lelei o faatoaga19,20,21. A lagona e laau faailoilo o le lamala, latou te gaosia ni avefeau lona lua e pei o le Ca2+ ma le phosphatidylinositol, faateleina ai le maualuga o le calcium ion i totonu o le sela ma faagaoioia le fesoʻotaʻiga faatonutonu o le auala o le phosphorylation o polotini22,23. O le polotini mulimuli e aofia saʻo i le puipuiga o sela pe faatonutonuina le faʻaalia o kene e fesoʻotaʻi ma le atuatuvale e ala i TFs, faʻaleleia atili ai le onosaia o laau i le atuatuvale24,25. O le mea lea, e taua tele le sao o TFs i le tali atu i le atuatuvale o le lamala. E tusa ai ma le faasologa ma meatotino e fusifusia ai le DNA o TFs e tali atu i le atuatuvale o le lamala, e mafai ona vaevaeina TFs i ni aiga eseese, e pei o le GRF, ERF, MYB, WRKY ma isi aiga26.
O le aiga o le kene GRF o se ituaiga o TF fa'apitoa mo la'au e iai sona sao taua i vaega eseese e pei o le tuputupu a'e, atina'e, fa'aliliuina o fa'ailoilo ma tali puipuia o la'au27. Talu mai le ulua'i kene GRF na fa'ailoaina i le O. sativa28, ua fa'ateleina pea kene GRF ua fa'ailoaina i le tele o ituaiga ma ua fa'aalia e a'afia ai le tuputupu a'e o la'au, atina'e ma le tali atu i le atuatuvale8, 29, 30,31,32. Faatasi ai ma le lolomiina o le fa'asologa o le kene Brassica juncea, ua mafai ai ona fa'ailoaina le aiga o le kene BjGRF33. I lenei su'esu'ega, e 34 kene BjGRF na fa'ailoaina i le kene atoa o le sinapi ma fa'aigoaina o le BjGRF01–BjGRF34 e fa'atatau i lo latou tulaga o le chromosome. O nei mea uma e iai vaega o le QLQ ma le WRC e matua'i fa'asaoina. O le su'esu'eina o meatotino fa'aletino na fa'aalia ai o eseesega i le numera o amino acid ma mamafa molecular o polotini BjGRF (vagana ai le BjGRF28) e le'i taua, e fa'ailoa mai ai o tagata o le aiga BjGRF atonu e tutusa a latou galuega. O le au'ili'iliga o le fausaga o kene na fa'aalia ai o le 64.7% o kene BjGRF e 4 exons, o lo'o fa'ailoa mai ai o le fausaga o le kene BjGRF e fa'asaoina i le evolusione, ae o le aofa'i o exons i kene BjGRF10, BjGRF16, BjGRP28 ma le BjGRF29 e sili atu le tele. Ua fa'aalia e su'esu'ega o le fa'aopoopoina po'o le tapeina o exons po'o introns e mafai ona o'o atu ai i eseesega i le fausaga ma le galuega a kene, ma fa'atupuina ai ni kene fou34,35,36. O le mea lea, matou te mateina ai o le intron o le BjGRF na leiloa i le taimi o le evolusione, lea e ono mafua ai suiga i le galuega a kene. E ogatasi ma su'esu'ega o lo'o iai nei, na matou iloa ai fo'i o le aofa'i o introns e feso'ota'i ma le fa'aalia o kene. A tele le aofa'i o introns i totonu o se kene, e mafai e le kene ona vave tali atu i mea le lelei eseese.
O le faaluaina o kene o se mea taua tele i le evolusione o genomic ma genetics37. O suʻesuʻega e fesoʻotaʻi i ai ua faʻaalia ai o le faaluaina o kene e le gata ina faʻateleina ai le aofaʻi o kene GRF, ae o se auala foʻi e faʻatupuina ai ni kene fou e fesoasoani ai i laʻau e fetuʻunaʻi i tulaga leaga eseese o le siosiomaga38. E 48 paga kene faalua na maua i lenei suʻesuʻega, o nei mea uma o ni faaluaina o vaega, e faʻaalia ai o le faaluaina o vaega o le auala autu lea e faʻateleina ai le aofaʻi o kene i lenei aiga. Ua lipotia mai i tusitusiga e mafai e le faaluaina o vaega ona faʻalauiloa lelei le faʻateleina o sui o le aiga kene GRF i Arabidopsis ma le sitipoloperi, ma e leai se faaluaina o lenei aiga kene na maua i soʻo se ituaiga27,39. O taunuʻuga o lenei suʻesuʻega e ogatusa ma suʻesuʻega o loʻo iai i luga o aiga Arabidopsis thaliana ma sitipoloperi, ma faʻaalia ai e mafai e le aiga GRF ona faʻateleina le aofaʻi o kene ma faʻatupuina ni kene fou e ala i le faaluaina o vaega i laʻau eseese.
I lenei suʻesuʻega, e 34 kene BjGRF na faʻailoaina i le sinapi, lea na vaevaeina i ni aiga laiti e 3. O nei kene na faʻaalia ai ni motif faʻasaoina tutusa ma fausaga o kene. O le suʻesuʻega o le collinearity na faʻaalia ai le 48 paga o le faaluaina o vaega i le sinapi. O le vaega faʻalauiloa o le BjGRF o loʻo i ai elemene cis-acting e fesoʻotaʻi ma le tali atu i le malamalama, tali atu i hormones, tali atu i le atuatuvale o le siosiomaga, ma le tuputupu aʻe ma le atinaʻe. O le faʻaalia o kene BjGRF e 34 na iloa i le tulaga o le totoina o le sinapi (aʻa, ogalaau, lau), ma le mamanu o le faʻaalia o kene BjGRF e 10 i lalo o tulaga o le lāmala. Na maua ai o mamanu o le faʻaalia o kene BjGRF i lalo o le atuatuvale o le lāmala e tutusa ma atonu e tutusa. auai i le faʻatonutonuina o le faʻamalosia o le lāmala. O kene BjGRF03 ma le BjGRF32 atonu e iai ni matafaioi faʻatonutonu lelei i le atuatuvale o le lāmala, ae o le BjGRF06 ma le BjGRF23 e iai sao i le atuatuvale o le lāmala o ni kene faʻatatau miR396. I le aotelega, o la matou suʻesuʻega e maua ai se faʻavae faʻale-biology mo le mauaina i le lumanaʻi o le galuega a le kene BjGRF i laʻau Brassicaceae.
O fatu sinapi na faʻaaogaina i lenei faʻataʻitaʻiga na saunia e le Guizhou Oil Seed Research Institute, Guizhou Academy of Agricultural Sciences. Filifili fatu atoa ma totō i le eleele (substrate: eleele = 3:1), ma ao mai aʻa, au ma lau pe a uma le laʻasaga e fa lau. Sa togafitia laʻau i le 20% PEG 6000 e faʻataʻitaʻi ai le lāmala, ma sa ao mai lau pe a uma le 0, 3, 6, 12 ma le 24 itula. O faʻataʻitaʻiga uma o laʻau sa faʻaʻaisa loa i le naitorosene vai ona teuina lea i totonu o le pusaaisa e -80°C mo le isi suʻega.
O faʻamaumauga uma na maua pe iloiloina i le taimi o lenei suʻesuʻega o loʻo aofia i totonu o le tusiga ua lolomiina ma faila faʻamatalaga faaopoopo.


Taimi na lafoina ai: Ianuari-22-2025